Nowy ustrój szkolny zaproponowany przez rządzących zakłada powrót do wcześniejszego systemu edukacji. Ta decyzja spowoduje, że szkoła podstawowa będzie trwała 8 lat, nauka w liceum zostanie wydłużona do 4, a z mapy placówek znikną gimnazja. Jednym z nich jest Gimnazjum nr 5 przy ul. Agrykola 6, które zostanie przemianowane na nierejonową Sportową Szkołę Podstawową od 2018 roku. Od 1 września 2013 przy gimnazjum działa założony w porozumieniu z Ministrem Sportu i Turystyki, Polskim Związkiem Piłki Nożnej oraz Warmińsko-Mazurskim Związkiem Piłki Nożnej Gimnazjalny Ośrodek Szkolenia Sportowego Młodzieży, do którego uczęszczają najzdolniejsi adepci futbolowi z miasta i okolic. W związku z reformą edukacyjną i w perspektywie wygaszania gimnazjów począwszy od 2017 roku, PZPN podjął decyzję o likwidacji wszystkich ośrodków GOSSM, także tego w Elblągu.

Powołanie do życia GOSSM w Elblągu zapewniało młodym piłkarzom najlepsze warunki do rozwoju pod okiem wykwalifikowanej kadry szkoleniowej. Zajęcia w tygodniu odbywają się w zakresie praktyki i doskonalenia indywidualnych umiejętności oraz teorii w zależności od klasy (I, II, III gimnazjum). W województwie warmińsko-mazurskim istnieją dwa ośrodki: w Elblągu oraz Olsztynie, a w całej Polsce (łącznie z licealnymi ośrodkami szkoleniowymi) łącznie 34 (dla dziewcząt i chłopców). Likwidacja gimnazjów związana z wejściem w życie nowej ustawy o edukacji powoduje, że wszystkie GOSSM decyzją Polskiego Związku Piłki Nożnej przestaną istnieć.

Nie wiadomo jeszcze, co powstanie w zamian za Gimnazjalne Ośrodki Szkolenia Sportowego Młodzieży. O tym debatowali członkowie W-MZPN na ostatnim posiedzeniu zarządu:

- Zarząd zapoznał się z decyzją PZPN o likwidacji wszystkich GOSSM w związku z reformą edukacji. Gimnazja będą wygaszane począwszy od 2017 roku. Zwalniane w ten sposób środki finansowe trafią na nowe projekty szkoleniowe w wojewódzkich ZPN’ach. Prawdopodobnie już od września 2017 roku z chwilą zwolnienia środków z jednej klasy gimnazjum, powstaną w każdym województwie mobilne AMO - czytamy na stronie związku.